Ok, grazie della risposta, mi chiedevo solo se ci fossero dei design piu' soggetti ai disallineamenti/difetti piuttosto che altri. Dopotutto, i drive sono stati riprogettati piu' volte e ci sono modelli diversi...
Visto che sto' backupando i dischi sul C64 vero, ci tenevo ad usare un drive che copiasse con meno problemi possibile. 
La causa primaria di disallineamenti (a meno di non provocarli apposta facendo pastrocchi sull'hardware ovviamente) è la lettura di dischi con bad block (escluso l'errore 29) che, ovviamente SUL LUNGO ANDARE, provocano questo problema.
Questo perché la testina sbatte contro il fine-corsa, provocando il classico rumore "trrrr" (molto forte e a livello di mitragliatrice nei 1541, molto meno forte nei 1541-II) durante il caricamento. Questo movimento della testina ripeto sul lungo andare provoca un disallineamento.
Lungo andare significa comunque nel corso di ANNI di caricamenti CONTINUI e RIPETUTI di dischi contenenti bad block.
Al di là di questo, una causa di disallineamento può essere il trasporto (consigliabile trasportarlo con un disco all'interno a dispetto di quanto scritto sul manuale) o i movimenti bruschi (leggasi CADUTE) che incidono sui delicati movimenti del motorino passo-passo.
In ogni caso un disallineamento non incide assolutamente sulla scrittura o formattazione di un floppy: un drive disallineato (esattamente come un registratore disallineato) continuerà a leggere i "suoi" floppy, il problema è che quegli stessi floppy messi in un drive con l'allineatura corretta daranno problemi.
Considera comunque che in un drive usato un minimo di disallineatura è endemica, ma solitamente rientra nei margini di tolleranza (e di correzione) del drive.
PS Se ci sono problemi coi floppy ad alta densità non è colpa dell'allineatura ma dei floppy in questione, che sono da EVITARE (non rovinano il drive ma possono dare molti problemi con relativa perdita dei dati) con i drive per C64 e compatibili.
Le differenze tra i "compatibili" e gli "originali" risiedono per lo più nelle rom (che non potevano essere identiche per motivi legali quindi venivano riscritte "prendendo spunto" da quelle originali) che potrebbero dare problemi di compatibilità in casi molto remoti di particolari loader "schizzinosi" (penso al loader di Hollywood Poker Pro che continua a caricare tenendo la luce "drive" spenta) o programmi astrusi che fanno uso pesante del 1541 (nibbler tritatutto, creatori di errori su disco e similari).
